Plateforme LC-MS

Le spectromètre de masse à chromatographe liquide (LC-MS) est une technique clé de détection orthogonale pour les protéines. En combinant les capacités de séparation de la chromatographie liquide avec la haute résolution de la spectrométrie de masse, LC-MS reconnaît un large éventail de protéines à des niveaux variables, qui obtient une plus grande sensibilité et précision dans l'identification et la quantification des protéines dans divers produits biologiques, par rapport aux tests ELISA traditionnels.

Plate-forme LC-MS SHENTEK:

LeLC-MSLa plate-forme utilise des méthodes fiables de préparation d'échantillons de protéines pour divers produits biologiques, fournissant un service complet de cartographie et de quantification pour les protéines dérivées de cellules à l'aide de bases de données validées et de la technologie bioinformatique. SHENTEK fournit des rapports personnalisés avec des recommandations exploitables du concept au résultat.

1. Extraction d'un mélange de protéines ou purification à partir d'échantillons biologiques,

2. Détermination de la concentration en protéines (p. ex. dosages BCA ou Bradford),

3. Clivé protéolytiquement par des protéases (trypsine et lys-C généralement),

4. Fragments de protéines analysés par LC-MS/MS,

5. Analyse des fichiers de données MS par le biais de programmes de recherche de bases de données et de bioinformatique.

Couverture

Nous avons validé une large couverture de protéines pour différentes lignées cellulaires modifiées comme CHO-K1, CHO-S, Vero, HEK293, HEK293T, Sf9, BHK, E.coli, Pichia, S. cerevisiae, etc., par exemple, a validé la couverture de jusqu'à 7000 protéines pour les cellules CHO.

Compétence

Nous avons validé le flux de travail de la conception de l'étude au rapport d'analyse. Pour l'analyse des données, SHENTEK utilise actuellement deux approches: l'acquisition dépendante des données (DDA) et l'acquisition indépendante des données (DIA) avec l'apprentissage de l'IA dans l'analyse protéomique, pour obtenir une plus grande précision et une meilleure reproductibilité pour une analyse ciblée ou inconnue dans des mélanges complexes sur une large plage dynamique.

Personnalisation

1. Identification des espèces de protéines pour évaluer l'origine des protéines grâce à des marqueurs peptidiques spécifiques à l'espèce.

   
   

   

   
   

2. Caractérisation et quantification des antigènes HCP à haut risque pour le contrôle de la qualité des échantillons en cours de traitement et des produits finaux.

   
   

   

   
   

3. Analyse de la couverture des anticorps HCP pour sélectionner ELISA approprié pour le contrôle des bioprocédés spécifiques.